我國當前刑事政策除重視被告之權益外，亦重視犯罪被害人保護工作，因此制定犯罪被害人保護法，於87年5月27日奉　總統令公布施行，犯罪被害人保護法施行細則及犯罪被害人保護協會捐助及組織章程，亦奉　法務部分別於87年9月27日及88年1月21日發布施行。
　　依前揭法令規定，本會為財團法人，受法務部指揮監督，本會即於88年1月21日報奉法務部核准，並向台灣台北地方法院辦理財團法人設立登記，隨即於88年1月29日成立，台灣雲林辦事處則奉　總會之令於88年4月1日正式成立，又於92年12月12日奉　法務部指示組織變革，改由社會民間人士接主任委員乙職，其名稱改為財團法人犯罪被害人保護協會臺灣雲林分會，繼續服務雲林縣地區因犯罪行為被害而死亡者之遺屬及重傷、性侵害、家庭暴力、人口販運、少年、兒童等被害人之本人保護工作，辦公地址位於雲林縣虎尾鎮明正路38號（明德樓一樓/臺灣雲林地方檢察署第三辦公大樓一樓）。希望透過政府與民間建立保護網路，提供犯罪被害人協助及撫平傷痛，重建生活，維護社會安全福祉。